針對(duì)山東地區(qū)物種特點(diǎn)過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建

　　【摘要】通過(guò)借鑒其他過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)。利用圖書(shū)館和網(wǎng)絡(luò)資源搜集、查找、核對(duì)并收錄符合山東地區(qū)地理環(huán)境、物種分布特點(diǎn)的過(guò)敏原信息。建成數(shù)據(jù)庫(kù)并公布于互聯(lián)網(wǎng)上。供消費(fèi)者免費(fèi)查詢過(guò)敏原的物種來(lái)源、名稱、過(guò)敏原蛋白在蛋白質(zhì)網(wǎng)的統(tǒng)一登陸號(hào)、分類學(xué)名稱、通用拉丁名、通用英文名、抗原表位、結(jié)構(gòu)、糖蛋白構(gòu)成、過(guò)敏原蛋白性狀描述等信息。該數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)摸清山東省過(guò)敏原的大致種類。方便過(guò)敏原信息的查詢。有針對(duì)性地檢測(cè)過(guò)敏原。提高過(guò)敏性疾病的防治水平具有重要意義。

　　【關(guān)鍵詞】過(guò)敏原；數(shù)據(jù)庫(kù)；蛋白質(zhì)

　　前人們接觸過(guò)敏原的種類越來(lái)越復(fù)雜。資料顯示。目前已經(jīng)確認(rèn)的過(guò)敏原已達(dá)1500種［1］。發(fā)達(dá)約30％的人口受過(guò)敏性疾病影響［2］。因此。如何預(yù)測(cè)可能發(fā)生的過(guò)敏反應(yīng)?？焖儆行z測(cè)過(guò)敏原。對(duì)過(guò)敏性疾病的預(yù)防和治療至關(guān)重要。過(guò)敏原的種類和物候環(huán)境密切相關(guān)。不同或地區(qū)由于地理環(huán)境和物種分布的不同。形成了特定的過(guò)敏原群落。國(guó)外一些發(fā)達(dá)因醫(yī)學(xué)和食品安全的需要。已經(jīng)建立了針對(duì)本國(guó)物種特點(diǎn)的過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)。我國(guó)建立類似過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)過(guò)敏性疾病的防治以及過(guò)敏原檢測(cè)非常有必要。現(xiàn)就建立針對(duì)山東地區(qū)物種特點(diǎn)過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)的情況報(bào)告如下。

　　1建庫(kù)目的

　　每個(gè)地區(qū)因地理環(huán)境、氣候等差異。物種分布并不相同。過(guò)敏素質(zhì)基因也存在地區(qū)和種族多態(tài)性聚集性分布的現(xiàn)象。因此。引起過(guò)敏的過(guò)敏原種類在不同地區(qū)存在很大差異。一個(gè)人在某一地區(qū)居住出現(xiàn)過(guò)敏癥狀。在另一物候條件下不同的地區(qū)居住時(shí)過(guò)敏癥狀會(huì)消失或者加劇。對(duì)物候條件相似的地區(qū)建立過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)?？梢詫?duì)本地區(qū)過(guò)敏原物種進(jìn)行針對(duì)性篩查。可大大縮小過(guò)敏原篩查范圍。我國(guó)使用的過(guò)敏原試劑很多來(lái)自進(jìn)口。有些根本不適合我國(guó)或山東省的過(guò)敏原檢測(cè)。針對(duì)地區(qū)物種分布特點(diǎn)建立過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)后?？梢罁?jù)此數(shù)據(jù)庫(kù)。開(kāi)發(fā)針對(duì)某一地區(qū)過(guò)敏原檢測(cè)試劑。提高過(guò)敏原檢測(cè)的針對(duì)性和準(zhǔn)確性。避免使用本地區(qū)并不存在的過(guò)敏原對(duì)病人進(jìn)行檢測(cè)。對(duì)過(guò)敏性疾病的預(yù)防和治療非常必要。還可滿足大眾對(duì)過(guò)敏性疾病知識(shí)的需求。也為醫(yī)療、食品安全、科研工作提供了標(biāo)準(zhǔn)和參考。

　　2建庫(kù)方法

　?。?）借鑒與山東地區(qū)物候相似、物種分布相近的日本食品安全過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)（allergendatabaseforfoodsafety。ADFS）［3］及其他過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)。查閱《山東植物精要》、《動(dòng)物志》、《真菌學(xué)》、《昆蟲(chóng)學(xué)》。將在山東地區(qū)有物種分布的過(guò)敏原納入數(shù)據(jù)庫(kù)中。國(guó)外數(shù)據(jù)庫(kù)中沒(méi)有。而山東省有的物種。檢索國(guó)外其他過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)和國(guó)內(nèi)的有關(guān)文獻(xiàn)。確定是否為山東省過(guò)敏原。如果是。納入在建的數(shù)據(jù)庫(kù)中。并補(bǔ)充相關(guān)條目說(shuō)明。包括過(guò)敏原的編號(hào)。過(guò)敏原的種屬。過(guò)敏原的蛋白質(zhì)序列。易致的過(guò)敏性疾病種類。引起過(guò)敏性疾病的概率。地理分布特點(diǎn)等。

　?。?）建立檢索途徑：收集完過(guò)敏原數(shù)據(jù)后。將過(guò)敏原按動(dòng)物（animal）、植物（plant）、真菌（fun-gus）、昆蟲(chóng)（insect）、螨蟲(chóng)（mite）、麥角蛋白（gli-adin）、原生動(dòng)物（protozoan）、蠕蟲(chóng)（worm）、毒液／唾液（venom／salivary）。按過(guò)敏原名稱（name）、過(guò)敏原蛋白統(tǒng)一登陸號(hào)（uniprotacc）、分類學(xué)名稱（taxonamicname）、通用拉丁名（latinname）、通用英文名（englishname）、抗原表位（epitope）、結(jié)構(gòu)（structure）、糖蛋白構(gòu)成（sugar）、描述（descrip-tion）分別建立檢索途徑。

　　（3）建立網(wǎng)站連接：將通用拉丁名、通用英文名、抗原表位（epitope）、結(jié)構(gòu)（structure）、糖蛋白構(gòu)成（sugar）、描述（description）目錄下的條目與相應(yīng)的蛋白質(zhì)和基因網(wǎng)站建立連接。

　?。?）將建立好的過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)公布于互聯(lián)網(wǎng)上。對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站進(jìn)行更新、維護(hù)、完善。過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)中在過(guò)敏原名稱和過(guò)敏蛋白統(tǒng)一登錄號(hào)中分別建立了站外鏈接。目的是通過(guò)利用相應(yīng)核酸數(shù)據(jù)庫(kù)和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)給出過(guò)敏原分子信息。如基因信息和氨基酸序列信息。由于鏈接到的站外數(shù)據(jù)庫(kù)是實(shí)行實(shí)時(shí)更新。這要求本數(shù)據(jù)庫(kù)也要進(jìn)行定期更新。

　　3數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介和應(yīng)用

　　對(duì)物候條件近似的地區(qū)建立過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)?？梢詫?duì)本地區(qū)的過(guò)敏原有針對(duì)性地進(jìn)行篩查。可大大縮小篩查范圍。我國(guó)使用的過(guò)敏原試劑多來(lái)自國(guó)外。依據(jù)本數(shù)據(jù)庫(kù)可開(kāi)發(fā)針對(duì)本地區(qū)過(guò)敏原特點(diǎn)的過(guò)敏原檢測(cè)試劑。提高過(guò)敏原檢測(cè)的針對(duì)性和準(zhǔn)確性。避免使用本地區(qū)并不存在的過(guò)敏原對(duì)病人進(jìn)行檢測(cè)。節(jié)省人力和財(cái)力。同時(shí)對(duì)過(guò)敏性疾病的預(yù)防和治療非常必要。該過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)除為醫(yī)療、食品安全、科研工作提供了標(biāo)準(zhǔn)和參考外。還可滿足大眾對(duì)過(guò)敏性疾病知識(shí)的需求。是面向變態(tài)反應(yīng)領(lǐng)域的專業(yè)研究人員對(duì)過(guò)敏原信息查詢。也能滿足一般大眾對(duì)過(guò)敏原的認(rèn)識(shí)需求。數(shù)據(jù)庫(kù)共收錄13類。共1043種過(guò)敏原。其中食入性動(dòng)物過(guò)敏原49種。吸入性動(dòng)物過(guò)敏原15種、食入性植物過(guò)敏原297種、吸入性植物過(guò)敏原344種、食入性真菌過(guò)敏原1種、吸入性真菌過(guò)敏原57種、吸入性昆蟲(chóng)過(guò)敏原36種、吸入性螨蟲(chóng)過(guò)敏原88種、毒液／唾液過(guò)敏原54種、接觸性過(guò)敏原57種、麥角蛋白過(guò)敏原23種、蠕蟲(chóng)過(guò)敏原20種和原生動(dòng)物過(guò)敏原2種。數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄的784種過(guò)敏原源自山東地區(qū)的113個(gè)物種。用戶鍵入http：／／www。gmycx。com。進(jìn)入數(shù)據(jù)庫(kù)首頁(yè)。顯示數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介、搜索方法、過(guò)敏原檢索欄。搜索的方法包括過(guò)敏原種類搜索、過(guò)敏原物種檢索、過(guò)敏原名稱搜索和模糊搜索四種方法。使用任意一種搜索方法均可以查到過(guò)敏原相關(guān)信息。包括過(guò)敏原的名稱。源自物種的拉丁名、英文名、中文名。過(guò)敏原統(tǒng)一登錄號(hào)。蛋白質(zhì)和核酸結(jié)構(gòu)、糖蛋白以及相關(guān)描述。

　　目前國(guó)外過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)的一個(gè)重要功能是采用比較蛋白質(zhì)序列與已知過(guò)敏蛋白質(zhì)序列相似度的方法［3-4］對(duì)過(guò)敏性分子的致敏性進(jìn)行評(píng)估。這種功能可以用于食品商業(yè)化前的安全性評(píng)估。還可以對(duì)通過(guò)轉(zhuǎn)基因編碼的蛋白質(zhì)與已知過(guò)敏原進(jìn)行序列相似性比較。為轉(zhuǎn)基因食品商業(yè)化前的安全性評(píng)估提供重要依據(jù)。過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)和核酸數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接提供過(guò)敏原的蛋白質(zhì)和核酸編碼信息。在轉(zhuǎn)基因技術(shù)中?？梢员苊鈱⒕幋a過(guò)敏原蛋白的目的基因引入轉(zhuǎn)基因物種。避免新型過(guò)敏蛋白的產(chǎn)生。由于技術(shù)、資金限制。本數(shù)據(jù)庫(kù)尚不具備蛋白質(zhì)序列分析、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)分析以及致敏性評(píng)估功能。僅能作為過(guò)敏原知識(shí)的信息平臺(tái)供用戶及研究人員查詢使用。

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　　程芳1康爾恂2

《針對(duì)山東地區(qū)物種特點(diǎn)過(guò)敏原數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建》

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